怀孕了,但孕酮一直低.

健康咨询描述： 刚发现怀孕当天,有少量咖啡色的血
初月经是5月24日,末月经是5月28日,6月4日做人授,6月21日发现怀孕了,当天验血孕酮值只有4.45.HCG122.88医生开了(合计)12支黄体酮
绒毛膜促激素合计14支隔天打)7月2日HCG9924.PROG9.27(当天医生没有开黄体酮,只是开了绒毛膜促激素,而照B超怀孕5周,卵黄襄很大很漂亮(这是医生口诉).7月21日验血HCG49091,孕酮6.6。7月26日验血只有36179,孕酮5.2.照B超胚芽模糊,长径0.5CM,未见明显原始心管搏动,宫颈囊肿1.7*1.4CM(孕前是没有囊肿)

曾经的治疗情况和效果： 医生，我有甲减（但是我已经吃药两年,控制在正常范围,(3.86),只是发现怀孕时,有3天没有吃药,(却升了6.44),而后来吃了15天的药,降到3.15.

想得到怎样的帮助：医生, 麻烦你们给我一个详细的答案(我的心好难过,好不容易怀上,结果变成这样,)为什么我的孕酮不会升,(我的性激素6项都没问题,怀孕了,反而不会升,跟我的甲减有关吗，长了一个囊肿怕吗？