由于每个人机体的症状不同，对药物的耐受程度也会有所差别，所以反流性食管炎B级没有最佳的治疗方法。当出现反流性食管炎B级症状，可配合医生通过生活调理、药物干预、手术的方式进行治疗。
1.生活调理：当被医生诊断为反流性食管炎B级，在进食后不宜立即卧床休息，即使休息时也应该抬高床头20cm左右，休息前两小时内不可进食。日常生活中也应该避免食用巧克力、浓茶等降低食管括约肌压力的食物。对于硝苯地平片、硝酸甘油等可降低食管下括约肌压力的药物也应该避免服用。
2.药物干预：反流性食管炎B级直接损伤的因素是由于胆汁、胃酸、胃蛋白酶反流所导致，所以需在医生的指导下服用质子泵抑制剂或H2受体拮抗剂，如奥美拉唑肠溶片、雷贝拉唑肠溶片、西咪替丁片、雷尼替丁胶囊等。或服用氢氧化铝、碳酸氢钠等抗酸药物。也可配合医生服用伊托必利片、莫沙必利片等药物促进胃排空。
3.手术治疗：如果经生活调理或药物干预无效或症状持续加重的反流性食管炎患者，也可在医生的指导下进行腹腔镜下胃底折叠术的手术方式或内镜下微创手术进行治疗。
