大部分初中生焦虑抑郁是可以临床治愈的，治愈的标准指焦虑抑郁的症状基本上消失，可以恢复社会功能，如正常上学和工作等。
初中生焦虑和抑郁治愈率可以达到70%-80%，如果治疗及时，部分初中生患者会在几周内有明显缓解。但治疗需要一个过程，尤其是治疗的巩固和维持，即防止已经消失的焦虑抑郁症状反弹或加重。治疗周期一般需要半年到一年，以避免过早减量或停药。
治疗焦虑抑郁的同时也要加上心理治疗，因为焦虑抑郁患者没有躯体疾病，但初中生患者会有明显的人格特征。比如，初中生焦虑症患者通常胆小怕事，容易卡在死胡同里，抑郁症初中生患者会更加悲观绝望。针对这种情况，心理治疗可以通过认知疗法和精神分析帮助患者改变和调整自己。一些初中生患者还可能经历许多应激性不良事件，如人际关系问题或亲人去世等，而心理治疗也有助于缓解紧张或抑郁。
除药物和心理治疗外，饮食也同样重要，有助于治疗焦虑抑郁的食物有香蕉、合欢花、金针菜等。
