阿尔法氨基酸和贝塔氨基酸是两种不同类型的氨基酸，主要区别在于结构差异、生物功能不同、稳定性差异、合成途径不同、应用不同等。使用药物需就诊后遵照医生要求。
1.结构差异：阿尔法氨基酸的氨基和羧基分别位于中心碳原子的两侧，形成一个空间上的直线排列。这种结构在肽链中能够通过肽键相连的能力，从而形成蛋白质。贝塔氨基酸则有所不同，其氨基和羧基相隔一个额外的碳原子，导致侧链相对于中心碳的位置与阿尔法氨基酸相反，形成了一个弯曲的分子结构。这一结构差异使得β氨基酸不适合通过肽键形成长链，因而通常不会直接参与蛋白质的构建。
2.生物功能不同：阿尔法氨基酸是构成蛋白质的基本单元，人体内有20种标准的阿尔法氨基酸，通过不同的组合与序列，编码了生命体内几乎所有的蛋白质，执行着从催化反应到结构支撑等多种生物学功能。贝塔氨基酸在自然界中较为罕见，并不直接参与蛋白质的合成。
3.稳定性差异：阿尔法氨基酸构成的肽链容易受到酶的水解和氧化，这与它们在生命过程中的动态调控有关。贝塔氨基酸由于其独特的三维结构，形成的β-肽比α-肽具有更高的化学稳定性和抗酶解性，使得成为设计药物和生物材料的理想候选分子。
4.合成途径不同：阿尔法氨基酸在生物体内通过多种代谢途径合成，如转氨作用、脱羧作用等，也可从食物中摄取。贝塔氨基酸的生物合成途径较为特殊，通常不通过标准的代谢途径，更多是通过化学合成或微生物发酵获得。
5.应用不同：阿尔法氨基酸广泛用于食品、医药和化妆品等行业，作为营养补充剂或合成药物的原料。例如，赖氨酸、精氨酸和谷氨酸等都是常见的阿尔法氨基酸，在人体健康中扮演着重要角色。而贝塔氨基酸的应用相对较少，通常出现在特定的药物合成或研究中。
