沙眼衣原体感染的症状有眼部不适、泌尿生殖道感染症状、呼吸道感染症状、关节炎症、新生儿感染症状等。
1.眼部不适：主要表现为眼睛有异物感、畏光、流泪，还可能出现较多的黏液或黏液脓性分泌物。眼结膜会出现充血，严重时可侵犯角膜，影响视力，导致视力模糊等情况。
2.泌尿生殖道感染症状：男性常出现尿道炎，有尿道刺痒、灼痛，可伴轻重不同的尿频、尿急、尿痛等症状，尿道口还可能有轻度红肿，有浆液性或脓性分泌物。女性主要表现为宫颈炎、尿道炎等，可出现阴道分泌物异常、性交疼痛等。
3.呼吸道感染症状：可引起咽炎、鼻窦炎、支气管炎等。患者会有咽痛、咳嗽、咳痰等表现，有时还会伴有发热、乏力等全身症状。
4.关节炎症：相对少见，主要表现为关节肿胀、疼痛，活动受限。常见于膝关节、踝关节等大关节，可单个关节发病，也可多个关节同时受累。
5.新生儿感染症状：新生儿经产道感染后，可出现眼结膜炎、肺炎等。眼结膜炎一般在出生后5 - 12天发病，表现为眼睑肿胀、结膜充血、有脓性分泌物。肺炎则多在出生后2 - 4周发病，可出现咳嗽、气促等症状。
若怀疑有沙眼衣原体感染，应及时就医检查，明确诊断后按医生的建议进行规范治疗，治疗期间避免性行为，防止交叉感染，同时要注意个人卫生，保持良好的生活习惯。
