眼睛里有黄色的东西应根据睑裂斑、结膜结石、眼部炎症、眼外伤、先天性因素等病因治疗，可采取的方法有药物治疗、手术治疗等。
1. 睑裂斑：睑裂斑是一种向角膜表面生长的、与结膜相连的、球结膜隆起的、三角形的、球结膜结节。通常是由于长期的紫外线或光化学性暴露引起。一般无需特殊处理，当发生睑裂斑炎时，可遵医嘱使用普拉洛芬滴眼液、氟米龙滴眼液、玻璃酸钠滴眼液，若影响外观或反复慢性炎症，可考虑手术切除。
2. 结膜结石：结膜结石是在睑结膜表面出现的黄白色凝结物，常见于慢性结膜炎患者或老年人。主要是由脱落的上皮细胞和变性的白细胞凝固而成。对于无症状的结膜结石，一般不需要治疗。有异物感时，可在表面麻醉下用尖刀或异物针剔除，术后遵医嘱使用氧氟沙星眼膏、妥布霉素滴眼液、红霉素眼膏。
3. 眼部炎症：如结膜炎、角膜炎等，炎症刺激可导致眼部出现黄色分泌物。细菌感染引起的可遵医嘱用左氧氟沙星滴眼液、氯霉素滴眼液、头孢克肟胶囊；病毒感染引起的可用更昔洛韦眼用凝胶、阿昔洛韦滴眼液、利巴韦林颗粒；过敏引起的可使用色甘酸钠滴眼液、富马酸依美斯汀滴眼液、氯雷他定片。
4. 眼外伤：眼外伤后，局部组织损伤、出血，血液吸收过程中可能出现黄色渗出物等。应及时就医处理伤口，预防感染，根据损伤情况遵医嘱使用阿莫西林胶囊、云南白药胶囊、重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液促进恢复。
5. 先天性因素：部分人出生时眼部就带有黄色斑块等先天性异常。若不影响视力和外观，可定期观察；若影响明显，可根据具体情况选择合适的手术方式改善。
日常要注意保持眼部清洁，避免用手揉眼，减少眼部刺激，合理用眼，避免长时间用眼疲劳，定期进行眼部检查，出现不适及时就医。
