小便时龟头刺痛可能由多种原因引起，包括尿道炎、龟头炎、前列腺炎、尿路结石、性传播疾病等。
1. 尿道炎：多由细菌感染引起，如大肠杆菌等。不洁性生活、局部卫生不佳等是常见诱因。表现为尿频、尿急、尿痛等。治疗需应用抗生素，如左氧氟沙星，并注意多饮水，保持局部清洁。
2. 龟头炎：可因包皮过长、局部刺激等导致。龟头红肿、瘙痒、疼痛是常见症状。治疗需保持局部清洁，外用克霉唑乳膏等药物，如有包皮过长，必要时可行包皮环切术。
3. 前列腺炎：久坐、酗酒、性生活不规律等可能引发。除了尿痛，还可能有尿频、尿急、会阴部不适等。治疗包括应用抗生素，如头孢呋辛酯，以及避免久坐、戒酒、规律性生活等。
4. 尿路结石：结石在尿路中移动时，可能刺激尿道引起疼痛。疼痛可较为剧烈，还可能伴有血尿。较小的结石可通过多饮水、多运动等促进排出，较大的结石可能需要体外碎石或手术治疗。
5. 性传播疾病：如淋病、非淋菌性尿道炎等，多通过不洁性行为传播。除了尿痛，还可能有尿道口分泌物等。治疗需根据具体病原体选择相应的抗生素，如淋病可选用头孢曲松钠，同时应避免不洁性行为。
在日常生活中，应注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免不洁性行为，多喝水，勤排尿，避免久坐，适当运动。如症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。
